Compétitions 
3e tour préliminaire
Aller le mardi 28 juillet 2009, Retour le mardi 4 août 2009
| Aller | Retour | ||
| Salzbourg SV | 1-1 | 2-1 | Dinamo Zagreb |
| Slovan Bratislava | 0-2 | 0-2 | Olympiakos Le Pirée |
| Sparta Prague | 3-1 | 0-3 | Panathinaïkos Athènes |
| FC Zürich | 2-3 | 3-0 | NK Maribor |
| FK Bakou | 0-0 | 0-2 | Levski Sofia |
| Aktobe Lento | 0-0 | 3-4 | Maccabi Haïfa |
| APOEL Nicosie | 2-0 | 0-1 | Partizan Belgrade |
| Celtic Glasgow | 0-1 | 2-0 | Dinamo Moscou |
| Sheriff Tiraspol | 0-0 | 1-1 | Slavia Prague |
| FC Copenhague | 3-1 | 0-0 | Stabaek IF |
| Sporting Portugal | 0-0 | 2-1 | FC Twente |
| Chakhtior Donetsk | 2-2 | 0-0 | Politehnica Timisoara |
| FK Ventspils | 1-0 | 1-2 | BATE Borisov |
| RSC Anderlecht | 5-0 | 1-3 | Sivasspor |
| FC Levadia Tallinn | 0-1 | 0-1 | Debrecen VSC |
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